Korzystanie z dodatkowych wątków i sterowanie wykonywaniem bieżącego pozwalają precyzyjnie zarządzać współbieżnym realizowaniem zadań. W Clojure możemy w tym celu użyć dodatkowych typów referencyjnych: Future, Promise i Delay. Istnieją również odpowiednie klasy Javy realizujące podobne cele, a nawet typ Volatile, który pozwala tworzyć szybkie choć niebezpieczne odpowiedniki zmiennych.

Ref to typ referencyjny, dzięki któremu można wyrażać częste i jednoczesne zmiany stanów wielu współdzielonych tożsamości w synchroniczny sposób. Wykorzystywany jest tam, gdzie kilka wartości wskazywanych przez referencje zależy od siebie i modyfikacja ich wszystkich powinna być atomowa (np. przekazywanie środków między rachunkami bankowymi). Do obsługi Refów intensywnie wykorzystywana jest programowa pamięć transakcyjna (STM).

Agent to typ referencyjny podobny do Atomu. Dzięki niemu można wyrażać częste, niekoordynowane zmiany stanów współdzielonych tożsamości w asynchroniczny sposób. Wykorzystywane są na przykład do obsługi niezależnych zdarzeń czy jednokierunkowej komunikacji między komponentami realizującymi dostęp do jednego zasobu (równoległe pobieranie danych z sieci, zapis do jednego pliku przez wiele wątków itp.).

Wykonywanie współbieżne pozwala spożytkować moc obliczeniową więcej niż jednego procesora lub rdzenia, pomaga też w lepszym zarządzaniu czasem obliczeniowym, gdy niektóre operacje muszą oczekiwać na obsługę komunikacji międzyprocesowej lub podsystemu wejścia/wyjścia. Clojure proponuje przejrzystą i wygodną implementację wykonywania współbieżnego, wykorzystującą typy referencyjne i programową pamięć transakcyjną.